步骤如下：

前提步骤，如果你之前没用过百度站长平台。

一：注册百度账号并登陆 http://zhanzhang.baidu.com/

二：进入添加域名，验证域名，有别名验证，TXT验证和HTML代码验证三种。

已有账号且已验证请看这里：

一：访问 http://zn.baidu.com/cse/home/index

二：点击右边的 进入管理后台 【注意，不是API引擎这里。】

三：搜索引擎管理-新建搜索引擎

四：选择域名，填写名称，记录地址栏最后一串数字即可。

五：下一步，随便选一个，然后提交，这里不影响，ID我们已经获取。

六：来到自己网站-后台-页面-新增页面-页面模板选择百度搜索-填写页面名称和设置URL后发布。

七：进入外观-主题设置-基本设置-百度站内搜索-启用-填写ID-选择刚才添加的页面-保存即可。

OK，感谢鸟哥指点，其实我一开始申请错了地方，就是API那里，然后一直发现怪怪的。