Android程序要运行就必须有签名。平时我们用的debug版是用的debug签名，不用我们关心。当我们自己发布程序时，就需要自己的签名了。其实无论用哪个IDE开发，最终只是用了keytool和jarsigner这两个java工具来完成签名任务（在jdk的bin目录下）。其中keytool用来生成keystore（证书），jarsigner用来做签名。
keytool用法举例如下：

keytool -genkey -alias lincapp -keyalg RSA -keysize 1024 -keypass android -validity 365 -keystore lincapp.keystore -storepass android

jarsigner用法举例如下：

jarsigner -keystore lincapp.keystore -signedjar lincapp_signed.apk lincapp.apk lincapp

其实我们直接使用IDE提供的签名功能会更方便一些。
Eclipse：
项目右键—>Android Tools—>Export Singed Application Package,简单填写信息就可以了。注意要记住密码。

Android Studio：
Build—>Generate Signed APK, 过程与Eclipse类似。

参考：
http://www.cnblogs.com/ok-lanyan/archive/2013/04/02/2995462.html