最近在处理一组转录组数据时遇到一个问题,就是这个数据的参考基因组很大,有 10GB 多,Hisat2 总是会报错,于是找到该组数据的原文献,看到材料与方法里使用的是 bowtie2,所以就用 bowtie2 比对,就没有发生错误了。