本文作者：余光创，目前就读于香港大学公共卫生系，开发过多个R/Bioconductor包，包括 ChIPseeker, clusterProfiler, DOSE, ggtree, GOSemSim 和 ReactomePA。

进化树看起来和层次聚类很像。有必要解释一下两者的一些区别。

层次聚类的侧重点在于分类，把距离近的聚在一起。而进化树的构建可以说也是一个聚类过程，但侧重点在于推测进化关系和进化距离(evolutionary distance)。