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yuanj's blog
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yuanj\'s blog
发表于
2024-01-13 22:03:16
在宜宾与家人相见
昨天,我的家人自驾从敦煌来到宜宾,记忆中这是我的父母第一次来宜宾,而我的哥哥除了大一开学报道送我过来的时候来过一次之后,这是第二次来宜宾,在这千里之外与家人相见,内心还是比较感慨的。 ...
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CatUncle4
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2024-01-13 22:03:16
在宜宾与家人相见
昨天,我的家人自驾从敦煌来到宜宾,记忆中这是我的父母第一次来宜宾,而我的哥哥除了大一开学报道送我过来的时候来过一次之后,这是第二次来宜宾,在这千里之外与家人相见,内心还是比较感慨的。 ...
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JiaoYuan\'s blog
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2024-01-13 00:00:00
在宜宾与家人相见
昨天,我的家人自驾从敦煌来到宜宾,记忆中这是我的父母第一次来宜宾,而我的哥哥除了大一开学报道送我过来的时候来过一次之后,这是第二次来宜宾,在这千里之外与家人相见,内心还是比较感慨的。 ...
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yuanj\'s blog
发表于
2023-12-17 19:44:45
富集分析原理
对于基因集功能富集分析原理之前一直不怎么清楚,虽然已经可以做出 GO/KEGG 富集分析,但原理还没有去学习过,这显然是不行的。参考了许多老师的文章,写一下自己对于富集分析原理的理解。 ...
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2023-12-17 19:44:45
富集分析原理
对于基因集功能富集分析原理之前一直不怎么清楚,虽然已经可以做出 GO/KEGG 富集分析,但原理还没有去学习过,这显然是不行的。参考了许多老师的文章,写一下自己对于富集分析原理的理解。 ...
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CatUncle4
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2023-12-17 19:44:45
富集分析原理
对于基因集功能富集分析原理之前一直不怎么清楚,虽然已经可以做出 GO/KEGG 富集分析,但原理还没有去学习过,这显然是不行的。参考了许多老师的文章,写一下自己对于富集分析原理的理解。 ...
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yuanj\'s blog
发表于
2023-11-30 22:00:02
今天去了四川大学
周五早上要考导游证面试,我想着 … 能考过的几率不大(实在没时间准备),于是转变思想,反正也要来趟成都,不如去玩一玩,说走就走,昨天考完就收拾东西,今天就来了~ ...
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2023-11-30 22:00:02
今天去了四川大学
周五早上要考导游证面试,我想着 … 能考过的几率不大(实在没时间准备),于是转变思想,反正也要来趟成都,不如去玩一玩,说走就走,昨天考完就收拾东西,今天就来了~ ...
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今天去了四川大学
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2023-11-30 00:00:00
今天去了四川大学
周五早上要考导游证面试,我想着 … 能考过的几率不大(实在没时间准备),于是转变思想,反正也要来趟成都,不如去玩一玩,说走就走,昨天考完就收拾东西,今天就来了~ ...
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yuanj\'s blog
发表于
2023-11-24 21:56:13
DESeq2 差异表达分析
还是之前拿到的转录组数据,只有表达量矩阵是不行的,作为 RNA-seq 下游分析重要的一步,差异表达分析将不同处理下的基因表达数据同对照组做统计分析,筛选出具有显著表达变化的基因集,这一步对后面的研究是很有必要的。 ...
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2023-11-24 21:56:13
DESeq2 差异表达分析
还是之前拿到的转录组数据,只有表达量矩阵是不行的,作为 RNA-seq 下游分析重要的一步,差异表达分析将不同处理下的基因表达数据同对照组做统计分析,筛选出具有显著表达变化的基因集,这一步对后面的研究是很有必要的。 ...
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2023-11-24 21:56:13
DESeq2 差异表达分析
还是之前拿到的转录组数据,只有表达量矩阵是不行的,作为 RNA-seq 下游分析重要的一步,差异表达分析将不同处理下的基因表达数据同对照组做统计分析,筛选出具有显著表达变化的基因集,这一步对后面的研究是很有必要的。 ...
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DESeq2 差异表达分析
还是之前拿到的转录组数据,只有表达量矩阵是不行的,作为 RNA-seq 下游分析重要的一步,差异表达分析将不同处理下的基因表达数据同对照组做统计分析,筛选出具有显著表达变化的基因集,这一步对后面的研究是很有必要的。 ...
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yuanj\'s blog
发表于
2023-11-15 18:16:25
Gromacs 分子动力学模拟
近期做了一次分子动力学模拟实验,命令比较多,整理一下步骤,参考了生信实战的教程,但他们的教程存在很多问题,这里完善一下。以江苏大学一位师兄提供的蛋白文件为基础,前提是要去除小分子,否则 gromacs 会报错提示有非标准残基。 ...
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2023-11-15 18:16:25
Gromacs 分子动力学模拟
近期做了一次分子动力学模拟实验,命令比较多,整理一下步骤,参考了生信实战的教程,但他们的教程存在很多问题,这里完善一下。以江苏大学一位师兄提供的蛋白文件为基础,前提是要去除小分子,否则 gromacs 会报错提示有非标准残基。 ...
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2023-11-15 18:16:25
Gromacs 分子动力学模拟
近期做了一次分子动力学模拟实验,命令比较多,整理一下步骤,参考了生信实战的教程,但他们的教程存在很多问题,这里完善一下。以江苏大学一位师兄提供的蛋白文件为基础,前提是要去除小分子,否则 gromacs 会报错提示有非标准残基。 ...
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yuanj\'s blog
发表于
2023-11-08 17:16:08
对人类基因进行 GO 富集分析
最近有一位师兄找我帮忙写一些 R 语言代码,实际上我也不怎么会,网上「借鉴」一些,自己改一些,达到目的似乎也就可以了。但是日后可能要经常和 R 语言打交道,所以还是研究清楚一些比较好。本文说说对人类基因进行注释并做 GO 富集分析。 ...
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2023-11-08 17:16:08
对人类基因进行 GO 富集分析
最近有一位师兄找我帮忙写一些 R 语言代码,实际上我也不怎么会,网上「借鉴」一些,自己改一些,达到目的似乎也就可以了。但是日后可能要经常和 R 语言打交道,所以还是研究清楚一些比较好。本文说说对人类基因进行注释并做 GO 富集分析。 ...
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对人类基因进行 GO 富集分析
最近有一位师兄找我帮忙写一些 R 语言代码,实际上我也不怎么会,网上「借鉴」一些,自己改一些,达到目的似乎也就可以了。但是日后可能要经常和 R 语言打交道,所以还是研究清楚一些比较好。本文说说对人类基因进行注释并做 GO 富集分析。 ...
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yuanj\'s blog
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2023-11-08 16:56:08
Conda 的一些报错
昨天重装了系统,WSL 也重装了一下,之前我使用 R 的时候是通过 conda 来管理环境的,R 包夜通过 conda 来安装,但是今天安装 R 包时出现一些问题。 ...
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对人类基因进行 GO 富集分析
最近有一位师兄找我帮忙写一些 R 语言代码,实际上我也不怎么会,网上「借鉴」一些,自己改一些,达到目的似乎也就可以了。但是日后可能要经常和 R 语言打交道,所以还是研究清楚一些比较好。本文说说对人类基因进行注释并做 GO 富集分析。 ...
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发表于
2023-10-24 14:09:24
一次修改注释文件的经历
今天有一位师姐在看到我之前的基因家族鉴定帖子之后,请我帮忙修改一份注释文件,他们找了公司测得的文件,格式与标准的注释文件有所差别,于是我使用 Excel 和 Notepad++对文件的格式进行了修改。 ...
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一次修改注释文件的经历
今天有一位师姐在看到我之前的基因家族鉴定帖子之后,请我帮忙修改一份注释文件,他们找了公司测得的文件,格式与标准的注释文件有所差别,于是我使用 Excel 和 Notepad++对文件的格式进行了修改。 ...
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一次修改注释文件的经历
今天有一位师姐在看到我之前的基因家族鉴定帖子之后,请我帮忙修改一份注释文件,他们找了公司测得的文件,格式与标准的注释文件有所差别,于是我使用 Excel 和 Notepad++对文件的格式进行了修改。 ...
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发表于
2023-10-23 19:27:14
胡思乱想
今天看到三体第一部,罗辑深爱上自己为给白蓉完成生日礼物而想象出来的爱人,似乎到了一种他无法自拔的地步,于是他去看了心理医生,医生说:“大部分人的爱情对象也只是存在于自己的想象之中 。他们所爱的并不是现实中的她 (他 ) ,而只是想象中的她 (他 ) ,现实中的她 (他 )只是他们创造梦中情人的一个模板 ,他们迟早会发现梦中情人与模板之间的差异 ,如果适应这种差异他们就会走到一起 ,无法适应就分开 ,就这么简单 。你与大多数人的区别在于 :你不需要模板 。” ...
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胡思乱想
今天看到三体第一部,罗辑深爱上自己为给白蓉完成生日礼物而想象出来的爱人,似乎到了一种他无法自拔的地步,于是他去看了心理医生,医生说:“大部分人的爱情对象也只是存在于自己的想象之中 。他们所爱的并不是现实中的她 (他 ) ,而只是想象中的她 (他 ) ,现实中的她 (他 )只是他们创造梦中情人的一个模板 ,他们迟早会发现梦中情人与模板之间的差异 ,如果适应这种差异他们就会走到一起 ,无法适应就分开 ,就这么简单 。你与大多数人的区别在于 :你不需要模板 。” ...
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